Hola
pacosomaloso ,Respondiendo a una de tus preguntas: no, no cambia en el sentido de manejo de la distribución el hecho de que instales las herramientas que necesitas en tu distribución de Ubuntu. Sin embargo, si cambia mucho el hecho de tu "seguridad".
De hecho, por ponerte un ejemplo, yo uso Arch Linux y lo que hice fue importarle las herramientas que requiero.
Como te comentaron los anteriores usuarios, esas opciones son muy usadas(sobretodo la de Katoolin).