Bueno, hace un tiempo me encontré con un problema en mi instalación de Kali Linux la cual corro con la GUI gnome, muchas veces y sin mensajes ni errores visibles, me desaparecían los paneles de menú o barras superior e inferior.
Haciendo un poco de research sobre otras distros me encontré que con este pequeño script se resuelve el problema,
gconftool --recursive-unset /apps/panel
rm -rf ~/.gconf/apps/panel
pkill gnome-panel
Lo guarde como fix.sh y en la propiedades tilde la opcion de "permitir ejecutar archivo como un programa"
También lo he probado en kde y funciona, la ultima linea no hace nada en dicho caso ya que no estaría corriendo gnome-panel, pero resetea los paneles de menú y vuelven a mostrarse como deberían.
Comentarios constructivos y destructivos son bienvenidos.
Saludos
Gn0m3