Cito:
CitarLinux es más seguro por los aportes como SELinux y AppArmor, sin olvidar la extensa comunidad de desarrolladores que están constantemente revisando el código en busca de bugs y vulnerabilidades y mejorandolo con frecuencia. BSD no está tan auditado y por tanto, a pesar de que digan que en BSD es más fácil detectar y corregir errores por la jerarquía del equipo de desarrollo no es del todo cierto. OpenBSD es el BSD destinado a la seguridad y por tanto el más seguro, pero hasta qué punto... y más sabiendo que Theo de Raadt, jefe del proyecto OpenBSD y OpenSSH acordó dejar puertas traseras para que el FBI pudiese penetrar en estos sistemas.
Muy bien articulo, te recomiendo su lectura.
Fuente: http://www.linuxadictos.com/comparativa-bsd-vs-linux-toda-la-verdad.html